В Богородске впервые музей был открыт в 1901 году. В нём находились личные вещи местного крепостного астронома-самоучки К. И. Каплина-Тезикова: книги, бумаги, телескоп. Все они, однако, были утеряны со временем.

  Второе рождение музей пережил в 20-е годы. Организатором был старый большевик М.М. Хохлов. Он с помощью школьников собрал интересные коллекции ископаемых, образцы местной фауны. 

  И, наконец, в начале 60-х годов началась подготовка к новому возрождению музея. В августе 1965 года городской музей открылся в маленькой комнатке при музыкальной школе. К моменту открытия здесь имелось всего около 200 экспонатов.

  Он давал лишь некоторое представление о развитии промышленности в нашем городе. К тому времени уже имелся материал о кажевенных заводах г. Богородск, материалы о первых революционерах-большевиках.

  Богородчане любезно предоставляли в распоряжение музея старые фотографии с видами села, его кожевен, с портретами деловых людей, бывших хозяев производства. Сохранилась уникальная вещь - писцовая книга 1774 года, в которой переписанно всё население с. Богородского.

  Со дня основания музея до середины 70-х годов его бессменным директором на общественных началах (музей сначала открывался для посетителей всего один раз в неделю) был ААлексей Иванович Голубев.

  Из года в год росли связи с предприятиями, школами города, с нашими земляками и их родственниками. Обо всех новинках Алексей Иванович сообщал населению в публикациях в "Ленинской победе".

  В середине 70-х годов на посту директора музея А.И. Голубева в связи с его тяжёлой болезнью сменила учительница истории Нина Николаевна Малькова. Она умело и с желанием взялась за работу. Её правой рукой во всех делах был муж, тоже историк - Семён Илларионович Рубцов. Он принмал на хранение экспонаты, обрабатывал их, выполнял обязанности хранителя фонда и смотрителя, ярко, доходчиво, интересно проводил экскурсии. 

  Организовывались выставки к 35-летию Великой Победы и 110-летию со дня рождения В.И. Ленина, 75-летию А.Ф. Брагина и т.д.

  Большой заслугой Н,Н, МАльковой и С.И. Рубцова стало то, что их усилиями при непосредсвенной помощи и участии тогдашних секретаря горкома КПСС Л.Р. Башкировой и заведующей отделом культуры Л. П. Фроловой музей получил новую прописку в здании Дома пионеров, что в старом парке на улице Фрунзе. 

  Новоселье справили в мае 1983 года. Для экспонатов выделено светлое, просторное помещение. Именно Нине Николаевне пришлось тщательно разрабатывать, обсуждать с научными сотрудниками из областного историко-архитектурного музея-заповедника содержание каждой витрины, расположение материалов, общий вид экспозиций. И они стали соответствовать современным научным и эстетическим требованиям. 

  Музей рос, усиливался и интерес богородчан к истории своей малой родиы. Всё чаще здесь стали проводиться экскурсии, уроки истории, различные мероприятия, несмотря на то что он был открыт всего два раза в неделю. 

  Музей стал грать заметную роль не только в деле знакомства с историей развития города и района, но и в воспитании патриотизма у подрастающего поколения. В хранилище находилось множество подлинных памятников истории и культуры, представляющих научную, историческую и художественную ценность. Нина Николавена и Семён Илларионович постоянно искали новые экпонаты, вели переписку с людьми, просили пожертвовать ценные для истории фотографии и документы.

  И вот 18 мая 1985 года Богородскому музею присваивается звание народного и вручается памятное свидетельство. 

  С 1 августа 1988 года музей был преобразован в филиал Горьковского государственного историко-архитектурного музея-заповедника. Увеличился штат сотрудников. Это позволило расширить и углубить научно-исследовательскую, поисковую и фондовую работу. Директором музея стала Н.Н. Дудина.

  Музей практически осуществляет главный принцип жизни: принцип преемственности и опоры на традиции. 

  С 1997 года директором музея становится Владимир Васильевич Башкиров. Он вместе со своей женой Людмилой Романовной Башкировой (научный сотрудник музея) пополняли коллекции музеев, вели увлекательные экскурсии для богородчан и гостей города, а также писали краеведческую литературу. 

  В 2001 году, после смерти В.В. Башкирова директором становится Марина Алексеевна Смирнова, оторая пробыла директором 18 лет. В должности директора Марина Алексеевна продолжила пополнять фонды музея, разрабатывать интерсные и познавательные экскурсии и мероприятия.

  При Марине Алексеевне, в 2012 году музей переезжает в новое просторное и светлое здание по ул. Ленина, 222.

  В 2020 году директором музея становится Марьев Дмитрий Юрьевич, который долгое время работал с Мариной Алексеевной.